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Ponencia
 

Modelagem e decomposição de redes de coevolução de aminoácidos

aplicações na determinação de especificidade e anotação de proteínas

Por:
Fonseca, Neli enviar el email al autor Universidade Federal de Minas Gerais
Carrijo, Lucas enviar el email al autor Universidade Federal de Minas Gerais
Querino, Marcelo enviar el email al autor Universidade Federal de Minas Gerais

Publicado en: 2018

Este trabajo forma parte del evento:
Jornadas de Jóvenes Investigadores AUGM (26º : 2018 : Mendoza, Argentina)
A 100 años de la Reforma Universitaria: saber te hace libre

Realizado en la fecha: 17, 18 y 19 de Octubre de 2018
Parte de la mesa: 017 Eje temático 17: Ciencia, Tecnología e Innovación


Resumen:
Portugués

Estudos de evolução molecular por técnicas computacionais são geralmente conduzidos a partir de um alinhamento múltiplo de sequências homólogas, no qual sequências provavelmente originadas por um ancestral comum são alinhadas de forma que aminoacidos equivalentes ocupem a mesma posição. Padrões de conservação de resíduos em um alinhamento, ou em um subconjunto de suas sequências, podem ser extremamente informativos por sugerirem posições sob seleção e restrição evolutiva. Neste trabalho desenvolvemos uma metodologia baseado em ciências das redes, com objetivo de identificar grupos de resíduos e propriedades estereoquímicas funcionalmente relacionados, através da análise de coocorrência e detecção de comunidades. A metodologia foi aplicada as famílias das Transtiretinas/HIUases e dos receptores acoplados a proteína G (classe A). Em ambos os casos foram obtidos com sucesso grupos de resíduos determinantes de especificidade para diversas subclasses funcionais. Estes dados foram posteriormente utilizados como estimadores para uma máquina de suporte de vetores (SVM) que foi capaz de classificar corretamente até mesmo subclasses, a quais nenhum resíduo específico foi identificado. A classificação por SVM foi também aplicada as GPCRs órfãs gerando novas hipóteses a respeito das classes funcionais destas sequências



Disciplinas:
Ciencias e Investigación - Tecnología


Palabras clave :
Secuencias homólogas - Selección y restricción evolutiva


Descriptores:
EVOLUCIÓN MOLECULAR - BIOINFORMÁTICA - ENSEÑANZA PROGRAMADA




Cómo citar este trabajo:


Fonseca, Neli; Carrijo, Lucas; Querino, Marcelo . (2018). Modelagem e decomposição de redes de coevolução de aminoácidos.
Ponencia Mendoza, .
Dirección URL del informe: /13062.
Fecha de consulta del artículo: 29/10/20.
 
 


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